Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMTP48728 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMTP48728 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMTP48728 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMTP48728 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AMTP48728 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AMTP48728 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AMTP48728 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AMTP48728 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMTP48728 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMTP48728 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMTP48728 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMTP48728 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMTP48728 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMTP48728 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMTP48728 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMTP48728 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMTP48728 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMTP48728 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMTP48728 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMTP48728 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMTP48728 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMTP48728 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMTP48728 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMTP48728 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMTP48728 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMTP48728 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMTP48728 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMTP48728 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMTP48728 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMTP48728 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMTP48728 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms