Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
NESP48681 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NESP48681 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
NESP48681 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
NESP48681 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
NESP48681 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
NESP48681 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
NESP48681 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
NESP48681 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
NESP48681 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NESP48681 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NESP48681 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
NESP48681 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
NESP48681 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
NESP48681 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
NESP48681 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
NESP48681 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
NESP48681 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NESP48681 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
NESP48681 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
NESP48681 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
NESP48681 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
NESP48681 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
NESP48681 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NESP48681 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NESP48681 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
NESP48681 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NESP48681 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
NESP48681 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NESP48681 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NESP48681 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NESP48681 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NESP48681 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
NESP48681 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
NESP48681 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
NESP48681 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
NESP48681 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
NESP48681 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
NESP48681 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
NESP48681 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
NESP48681 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
NESP48681 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
NESP48681 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
NESP48681 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
NESP48681 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NESP48681 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NESP48681 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NESP48681 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NESP48681 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NESP48681 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
NESP48681 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC44.65■■■■■ 4.74
NESP48681 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
NESP48681 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
NESP48681 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
NESP48681 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC44.64■■■■■ 4.74
NESP48681 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
NESP48681 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
NESP48681 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
NESP48681 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NESP48681 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NESP48681 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NESP48681 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
NESP48681 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NESP48681 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NESP48681 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
NESP48681 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
NESP48681 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
NESP48681 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NESP48681 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NESP48681 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NESP48681 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NESP48681 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NESP48681 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
NESP48681 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
NESP48681 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NESP48681 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
NESP48681 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NESP48681 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NESP48681 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
NESP48681 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
NESP48681 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
NESP48681 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NESP48681 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
NESP48681 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NESP48681 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
NESP48681 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
NESP48681 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
NESP48681 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms