Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC6A9P48067 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A9P48067 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A9P48067 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms