Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XCR1P46094 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XCR1P46094 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XCR1P46094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XCR1P46094 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XCR1P46094 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XCR1P46094 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XCR1P46094 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XCR1P46094 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XCR1P46094 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XCR1P46094 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XCR1P46094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XCR1P46094 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XCR1P46094 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XCR1P46094 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XCR1P46094 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XCR1P46094 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XCR1P46094 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XCR1P46094 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XCR1P46094 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XCR1P46094 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XCR1P46094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XCR1P46094 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XCR1P46094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XCR1P46094 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XCR1P46094 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XCR1P46094 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XCR1P46094 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XCR1P46094 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XCR1P46094 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XCR1P46094 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XCR1P46094 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XCR1P46094 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XCR1P46094 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XCR1P46094 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XCR1P46094 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XCR1P46094 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XCR1P46094 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XCR1P46094 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XCR1P46094 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XCR1P46094 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XCR1P46094 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms