Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A2P43004 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A2P43004 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A2P43004 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A2P43004 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms