Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA3P42263 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA3P42263 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA3P42263 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA3P42263 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms