Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K8P41279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K8P41279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K8P41279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K8P41279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms