Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPHP41219 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPHP41219 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPHP41219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRPHP41219 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPHP41219 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPHP41219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPHP41219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPHP41219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPHP41219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPHP41219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPHP41219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPHP41219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPHP41219 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPHP41219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPHP41219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPHP41219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPHP41219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPHP41219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPHP41219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPHP41219 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPHP41219 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPHP41219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPHP41219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPHP41219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPHP41219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPHP41219 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPHP41219 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPHP41219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPHP41219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPHP41219 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPHP41219 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPHP41219 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPHP41219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPHP41219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPHP41219 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPHP41219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPHP41219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPHP41219 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPHP41219 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPHP41219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPHP41219 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPHP41219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPHP41219 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPHP41219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPHP41219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPHP41219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPHP41219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPHP41219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPHP41219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPHP41219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPHP41219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPHP41219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPHP41219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPHP41219 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPHP41219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPHP41219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPHP41219 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPHP41219 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPHP41219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRPHP41219 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPHP41219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPHP41219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPHP41219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPHP41219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPHP41219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPHP41219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPHP41219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPHP41219 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPHP41219 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPHP41219 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms