Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDH1P40925 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDH1P40925 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDH1P40925 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDH1P40925 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDH1P40925 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MDH1P40925 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDH1P40925 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDH1P40925 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDH1P40925 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDH1P40925 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDH1P40925 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MDH1P40925 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDH1P40925 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDH1P40925 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDH1P40925 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDH1P40925 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDH1P40925 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDH1P40925 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDH1P40925 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDH1P40925 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDH1P40925 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDH1P40925 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDH1P40925 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDH1P40925 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDH1P40925 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDH1P40925 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MDH1P40925 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDH1P40925 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDH1P40925 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDH1P40925 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDH1P40925 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDH1P40925 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDH1P40925 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDH1P40925 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDH1P40925 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDH1P40925 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDH1P40925 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDH1P40925 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDH1P40925 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDH1P40925 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDH1P40925 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDH1P40925 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDH1P40925 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDH1P40925 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDH1P40925 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDH1P40925 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDH1P40925 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDH1P40925 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDH1P40925 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDH1P40925 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDH1P40925 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDH1P40925 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDH1P40925 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDH1P40925 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDH1P40925 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDH1P40925 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDH1P40925 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDH1P40925 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDH1P40925 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDH1P40925 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDH1P40925 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDH1P40925 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDH1P40925 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDH1P40925 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDH1P40925 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDH1P40925 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDH1P40925 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDH1P40925 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms