Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB10P40306 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB10P40306 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB10P40306 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms