Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFHR2P36980 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFHR2P36980 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CFHR2P36980 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFHR2P36980 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms