Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATP7BP35670 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP7BP35670 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7BP35670 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7BP35670 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms