Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN2P35609 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN2P35609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN2P35609 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms