Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSP35520 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBSP35520 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBSP35520 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSP35520 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSP35520 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSP35520 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSP35520 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSP35520 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSP35520 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSP35520 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSP35520 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSP35520 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSP35520 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSP35520 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSP35520 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSP35520 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSP35520 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSP35520 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSP35520 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBSP35520 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBSP35520 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSP35520 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSP35520 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSP35520 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSP35520 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSP35520 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSP35520 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSP35520 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSP35520 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSP35520 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSP35520 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSP35520 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBSP35520 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSP35520 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBSP35520 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBSP35520 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSP35520 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSP35520 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSP35520 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSP35520 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSP35520 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSP35520 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSP35520 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSP35520 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBSP35520 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBSP35520 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSP35520 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSP35520 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSP35520 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBSP35520 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms