Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXD13P35453 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD13P35453 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD13P35453 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOXD13P35453 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD13P35453 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD13P35453 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD13P35453 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD13P35453 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD13P35453 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD13P35453 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD13P35453 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD13P35453 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD13P35453 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD13P35453 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD13P35453 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD13P35453 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD13P35453 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD13P35453 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD13P35453 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD13P35453 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD13P35453 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD13P35453 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD13P35453 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD13P35453 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD13P35453 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD13P35453 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD13P35453 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms