Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GALNSP34059 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALNSP34059 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GALNSP34059 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALNSP34059 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALNSP34059 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GALNSP34059 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GALNSP34059 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GALNSP34059 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GALNSP34059 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GALNSP34059 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GALNSP34059 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GALNSP34059 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GALNSP34059 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALNSP34059 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALNSP34059 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALNSP34059 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GALNSP34059 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GALNSP34059 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GALNSP34059 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GALNSP34059 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GALNSP34059 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GALNSP34059 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALNSP34059 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALNSP34059 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALNSP34059 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GALNSP34059 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GALNSP34059 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GALNSP34059 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GALNSP34059 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GALNSP34059 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GALNSP34059 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GALNSP34059 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GALNSP34059 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GALNSP34059 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GALNSP34059 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNSP34059 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNSP34059 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALNSP34059 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNSP34059 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNSP34059 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALNSP34059 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALNSP34059 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GALNSP34059 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALNSP34059 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALNSP34059 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALNSP34059 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNSP34059 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNSP34059 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALNSP34059 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GALNSP34059 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALNSP34059 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALNSP34059 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALNSP34059 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALNSP34059 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms