Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRM2P31350 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2P31350 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2P31350 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2P31350 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2P31350 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRM2P31350 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2P31350 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2P31350 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2P31350 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRM2P31350 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM2P31350 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM2P31350 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM2P31350 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2P31350 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM2P31350 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2P31350 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2P31350 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2P31350 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM2P31350 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM2P31350 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM2P31350 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2P31350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2P31350 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2P31350 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2P31350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM2P31350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM2P31350 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRM2P31350 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2P31350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2P31350 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2P31350 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRM2P31350 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2P31350 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2P31350 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRM2P31350 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2P31350 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2P31350 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRM2P31350 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRM2P31350 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRM2P31350 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRM2P31350 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2P31350 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2P31350 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2P31350 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2P31350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRM2P31350 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2P31350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2P31350 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM2P31350 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM2P31350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM2P31350 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM2P31350 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM2P31350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms