Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXC13P31276 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC13P31276 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC13P31276 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms