Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC27P30260 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC27P30260 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC27P30260 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC27P30260 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC27P30260 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC27P30260 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC27P30260 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC27P30260 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC27P30260 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC27P30260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CDC27P30260 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC27P30260 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC27P30260 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC27P30260 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC27P30260 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC27P30260 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC27P30260 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC27P30260 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC27P30260 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC27P30260 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC27P30260 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDC27P30260 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC27P30260 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC27P30260 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC27P30260 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC27P30260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC27P30260 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC27P30260 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC27P30260 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC27P30260 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC27P30260 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC27P30260 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC27P30260 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC27P30260 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC27P30260 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC27P30260 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC27P30260 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC27P30260 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC27P30260 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC27P30260 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDC27P30260 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDC27P30260 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC27P30260 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC27P30260 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC27P30260 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC27P30260 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC27P30260 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC27P30260 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC27P30260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC27P30260 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC27P30260 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC27P30260 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC27P30260 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC27P30260 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC27P30260 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC27P30260 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC27P30260 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC27P30260 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC27P30260 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC27P30260 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC27P30260 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC27P30260 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC27P30260 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC27P30260 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC27P30260 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC27P30260 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC27P30260 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC27P30260 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC27P30260 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC27P30260 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC27P30260 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC27P30260 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC27P30260 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms