Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRMP28827 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRMP28827 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRMP28827 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTPRMP28827 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRMP28827 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRMP28827 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms