Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB3P28472 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB3P28472 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GABRB3P28472 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB3P28472 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB3P28472 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms