Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA3P26006 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA3P26006 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA3P26006 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms