Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA2P25787 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMA2P25787 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMA2P25787 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA2P25787 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms