Protein–RNA interactions for Protein: P24557

TBXAS1, Thromboxane-A synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1P24557 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBXAS1P24557 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TBXAS1P24557 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TBXAS1P24557 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBXAS1P24557 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBXAS1P24557 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms