Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPREP23469 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPREP23469 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPREP23469 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPREP23469 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPREP23469 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPREP23469 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPREP23469 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPREP23469 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPREP23469 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPREP23469 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPREP23469 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPREP23469 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPREP23469 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPREP23469 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPREP23469 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPREP23469 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPREP23469 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPREP23469 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPREP23469 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPREP23469 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPREP23469 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPREP23469 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPREP23469 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPREP23469 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPREP23469 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPREP23469 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPREP23469 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPREP23469 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPREP23469 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPREP23469 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPREP23469 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPREP23469 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPREP23469 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPREP23469 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPREP23469 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPREP23469 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPREP23469 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPREP23469 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPREP23469 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPREP23469 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPREP23469 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPREP23469 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPREP23469 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPREP23469 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPREP23469 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPREP23469 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPREP23469 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPREP23469 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPREP23469 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPREP23469 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPREP23469 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPREP23469 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPREP23469 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPREP23469 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPREP23469 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPREP23469 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPREP23469 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPREP23469 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPREP23469 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPREP23469 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPREP23469 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPREP23469 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPREP23469 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPREP23469 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPREP23469 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPREP23469 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPREP23469 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPREP23469 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms