Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
S1PR1P21453 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
S1PR1P21453 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
S1PR1P21453 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR1P21453 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms