Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA1P20827 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA1P20827 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFNA1P20827 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms