Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN3P20807 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN3P20807 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN3P20807 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN3P20807 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms