Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM21P19474 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM21P19474 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM21P19474 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM21P19474 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM21P19474 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM21P19474 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM21P19474 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM21P19474 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM21P19474 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM21P19474 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM21P19474 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM21P19474 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM21P19474 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM21P19474 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM21P19474 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM21P19474 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM21P19474 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM21P19474 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM21P19474 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM21P19474 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM21P19474 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM21P19474 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms