Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD53P19397 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD53P19397 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD53P19397 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD53P19397 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD53P19397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD53P19397 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD53P19397 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD53P19397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD53P19397 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD53P19397 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD53P19397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD53P19397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD53P19397 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD53P19397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD53P19397 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD53P19397 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD53P19397 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD53P19397 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD53P19397 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD53P19397 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD53P19397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD53P19397 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD53P19397 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD53P19397 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD53P19397 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD53P19397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD53P19397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD53P19397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD53P19397 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD53P19397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD53P19397 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD53P19397 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD53P19397 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD53P19397 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD53P19397 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD53P19397 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD53P19397 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD53P19397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD53P19397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD53P19397 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD53P19397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD53P19397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD53P19397 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD53P19397 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD53P19397 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD53P19397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD53P19397 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD53P19397 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD53P19397 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD53P19397 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD53P19397 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD53P19397 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD53P19397 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD53P19397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD53P19397 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD53P19397 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD53P19397 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD53P19397 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD53P19397 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD53P19397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD53P19397 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD53P19397 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD53P19397 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD53P19397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms