Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCLP18206 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCLP18206 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCLP18206 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCLP18206 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCLP18206 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCLP18206 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCLP18206 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCLP18206 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCLP18206 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCLP18206 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCLP18206 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCLP18206 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCLP18206 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCLP18206 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCLP18206 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCLP18206 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCLP18206 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCLP18206 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCLP18206 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCLP18206 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCLP18206 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VCLP18206 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCLP18206 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCLP18206 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCLP18206 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCLP18206 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VCLP18206 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCLP18206 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCLP18206 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCLP18206 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCLP18206 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VCLP18206 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCLP18206 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCLP18206 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCLP18206 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCLP18206 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCLP18206 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCLP18206 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VCLP18206 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCLP18206 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCLP18206 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCLP18206 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCLP18206 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCLP18206 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VCLP18206 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCLP18206 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCLP18206 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCLP18206 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCLP18206 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCLP18206 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCLP18206 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCLP18206 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCLP18206 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCLP18206 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCLP18206 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCLP18206 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCLP18206 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCLP18206 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCLP18206 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCLP18206 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCLP18206 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCLP18206 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCLP18206 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCLP18206 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCLP18206 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCLP18206 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCLP18206 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms