Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGFBP3P17936 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGFBP3P17936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGFBP3P17936 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGFBP3P17936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms