Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GM2AP17900 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GM2AP17900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GM2AP17900 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GM2AP17900 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GM2AP17900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GM2AP17900 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GM2AP17900 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GM2AP17900 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GM2AP17900 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GM2AP17900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GM2AP17900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GM2AP17900 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GM2AP17900 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GM2AP17900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GM2AP17900 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GM2AP17900 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GM2AP17900 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GM2AP17900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GM2AP17900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GM2AP17900 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GM2AP17900 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GM2AP17900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GM2AP17900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GM2AP17900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GM2AP17900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GM2AP17900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GM2AP17900 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GM2AP17900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GM2AP17900 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GM2AP17900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GM2AP17900 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GM2AP17900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GM2AP17900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GM2AP17900 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GM2AP17900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GM2AP17900 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GM2AP17900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GM2AP17900 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GM2AP17900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GM2AP17900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GM2AP17900 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GM2AP17900 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GM2AP17900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GM2AP17900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GM2AP17900 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GM2AP17900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GM2AP17900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GM2AP17900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GM2AP17900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GM2AP17900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GM2AP17900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GM2AP17900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GM2AP17900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GM2AP17900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GM2AP17900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GM2AP17900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GM2AP17900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GM2AP17900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms