Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMPD1P17405 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMPD1P17405 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMPD1P17405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMPD1P17405 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMPD1P17405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms