Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPCAMP16422 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPCAMP16422 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPCAMP16422 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPCAMP16422 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPCAMP16422 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPCAMP16422 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPCAMP16422 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPCAMP16422 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPCAMP16422 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms