Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSPP15924 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSPP15924 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSPP15924 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSPP15924 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSPP15924 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSPP15924 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSPP15924 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSPP15924 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSPP15924 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSPP15924 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSPP15924 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSPP15924 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSPP15924 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSPP15924 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSPP15924 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSPP15924 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSPP15924 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSPP15924 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSPP15924 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSPP15924 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSPP15924 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSPP15924 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSPP15924 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSPP15924 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSPP15924 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSPP15924 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSPP15924 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSPP15924 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSPP15924 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSPP15924 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSPP15924 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSPP15924 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSPP15924 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSPP15924 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSPP15924 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSPP15924 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSPP15924 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSPP15924 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSPP15924 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSPP15924 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSPP15924 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DSPP15924 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DSPP15924 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DSPP15924 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSPP15924 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSPP15924 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSPP15924 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DSPP15924 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSPP15924 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSPP15924 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DSPP15924 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DSPP15924 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DSPP15924 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms