Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYOD1P15172 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYOD1P15172 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYOD1P15172 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms