Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG2P13727 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG2P13727 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG2P13727 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG2P13727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG2P13727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG2P13727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG2P13727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG2P13727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG2P13727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG2P13727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG2P13727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG2P13727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG2P13727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG2P13727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG2P13727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG2P13727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG2P13727 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG2P13727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG2P13727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG2P13727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG2P13727 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRG2P13727 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG2P13727 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRG2P13727 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRG2P13727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG2P13727 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRG2P13727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG2P13727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG2P13727 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG2P13727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG2P13727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG2P13727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG2P13727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG2P13727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG2P13727 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG2P13727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG2P13727 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG2P13727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG2P13727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG2P13727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG2P13727 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG2P13727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG2P13727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG2P13727 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG2P13727 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG2P13727 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG2P13727 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG2P13727 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG2P13727 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG2P13727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG2P13727 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG2P13727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG2P13727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG2P13727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG2P13727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG2P13727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms