Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN1P12814 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN1P12814 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN1P12814 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN1P12814 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.6 ms