Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK4P11802 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK4P11802 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK4P11802 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK4P11802 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK4P11802 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK4P11802 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK4P11802 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK4P11802 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK4P11802 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK4P11802 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK4P11802 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK4P11802 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK4P11802 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK4P11802 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK4P11802 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK4P11802 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK4P11802 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK4P11802 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK4P11802 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK4P11802 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK4P11802 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK4P11802 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK4P11802 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK4P11802 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK4P11802 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK4P11802 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK4P11802 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK4P11802 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK4P11802 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK4P11802 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK4P11802 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK4P11802 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK4P11802 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK4P11802 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK4P11802 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK4P11802 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK4P11802 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK4P11802 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK4P11802 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK4P11802 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK4P11802 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK4P11802 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK4P11802 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK4P11802 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK4P11802 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK4P11802 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK4P11802 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK4P11802 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK4P11802 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK4P11802 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK4P11802 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK4P11802 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK4P11802 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK4P11802 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK4P11802 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK4P11802 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK4P11802 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK4P11802 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK4P11802 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK4P11802 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK4P11802 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK4P11802 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK4P11802 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK4P11802 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK4P11802 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK4P11802 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK4P11802 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK4P11802 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms