Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RALAP11233 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RALAP11233 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RALAP11233 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALAP11233 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALAP11233 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALAP11233 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALAP11233 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALAP11233 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALAP11233 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALAP11233 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALAP11233 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALAP11233 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RALAP11233 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RALAP11233 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RALAP11233 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RALAP11233 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RALAP11233 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RALAP11233 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RALAP11233 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RALAP11233 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RALAP11233 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RALAP11233 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALAP11233 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALAP11233 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALAP11233 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALAP11233 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALAP11233 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RALAP11233 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RALAP11233 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RALAP11233 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RALAP11233 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RALAP11233 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALAP11233 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RALAP11233 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RALAP11233 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RALAP11233 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RALAP11233 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RALAP11233 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RALAP11233 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RALAP11233 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RALAP11233 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RALAP11233 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RALAP11233 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RALAP11233 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RALAP11233 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RALAP11233 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RALAP11233 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RALAP11233 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALAP11233 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALAP11233 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALAP11233 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALAP11233 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALAP11233 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RALAP11233 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RALAP11233 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RALAP11233 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALAP11233 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALAP11233 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.3 ms