Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYGBP11216 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYGBP11216 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYGBP11216 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYGBP11216 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYGBP11216 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYGBP11216 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYGBP11216 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYGBP11216 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYGBP11216 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYGBP11216 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYGBP11216 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYGBP11216 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PYGBP11216 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYGBP11216 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYGBP11216 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYGBP11216 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYGBP11216 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYGBP11216 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYGBP11216 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYGBP11216 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYGBP11216 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYGBP11216 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYGBP11216 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYGBP11216 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYGBP11216 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PYGBP11216 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYGBP11216 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PYGBP11216 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYGBP11216 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYGBP11216 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYGBP11216 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYGBP11216 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYGBP11216 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYGBP11216 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PYGBP11216 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PYGBP11216 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PYGBP11216 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PYGBP11216 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PYGBP11216 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PYGBP11216 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYGBP11216 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PYGBP11216 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PYGBP11216 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PYGBP11216 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PYGBP11216 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PYGBP11216 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PYGBP11216 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGBP11216 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGBP11216 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGBP11216 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGBP11216 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PYGBP11216 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYGBP11216 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.2 ms