Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRBP10828 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRBP10828 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRBP10828 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THRBP10828 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRBP10828 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRBP10828 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THRBP10828 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRBP10828 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRBP10828 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRBP10828 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRBP10828 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THRBP10828 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THRBP10828 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRBP10828 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THRBP10828 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THRBP10828 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRBP10828 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THRBP10828 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THRBP10828 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
THRBP10828 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRBP10828 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
THRBP10828 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRBP10828 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRBP10828 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRBP10828 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRBP10828 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRBP10828 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRBP10828 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRBP10828 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRBP10828 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRBP10828 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRBP10828 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRBP10828 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRBP10828 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRBP10828 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRBP10828 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THRBP10828 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THRBP10828 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THRBP10828 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THRBP10828 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THRBP10828 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THRBP10828 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRBP10828 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRBP10828 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRBP10828 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRBP10828 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THRBP10828 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THRBP10828 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRBP10828 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRBP10828 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THRBP10828 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THRBP10828 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRBP10828 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THRBP10828 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
THRBP10828 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THRBP10828 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms