Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPP1P10451 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPP1P10451 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPP1P10451 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPP1P10451 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPP1P10451 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPP1P10451 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPP1P10451 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPP1P10451 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPP1P10451 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPP1P10451 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPP1P10451 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPP1P10451 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPP1P10451 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPP1P10451 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPP1P10451 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPP1P10451 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPP1P10451 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPP1P10451 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPP1P10451 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPP1P10451 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPP1P10451 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPP1P10451 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPP1P10451 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPP1P10451 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPP1P10451 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPP1P10451 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPP1P10451 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPP1P10451 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPP1P10451 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPP1P10451 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPP1P10451 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPP1P10451 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPP1P10451 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPP1P10451 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPP1P10451 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPP1P10451 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPP1P10451 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPP1P10451 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPP1P10451 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPP1P10451 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPP1P10451 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPP1P10451 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPP1P10451 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPP1P10451 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPP1P10451 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms