Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI3P10071 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI3P10071 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI3P10071 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI3P10071 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI3P10071 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI3P10071 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI3P10071 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI3P10071 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI3P10071 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI3P10071 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GLI3P10071 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI3P10071 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI3P10071 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI3P10071 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GLI3P10071 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GLI3P10071 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI3P10071 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI3P10071 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GLI3P10071 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI3P10071 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI3P10071 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI3P10071 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GLI3P10071 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GLI3P10071 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI3P10071 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GLI3P10071 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GLI3P10071 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI3P10071 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI3P10071 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GLI3P10071 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI3P10071 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI3P10071 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI3P10071 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GLI3P10071 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI3P10071 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GLI3P10071 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GLI3P10071 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GLI3P10071 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GLI3P10071 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GLI3P10071 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GLI3P10071 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI3P10071 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI3P10071 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GLI3P10071 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI3P10071 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI3P10071 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI3P10071 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI3P10071 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GLI3P10071 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI3P10071 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI3P10071 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GLI3P10071 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI3P10071 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI3P10071 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI3P10071 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GLI3P10071 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI3P10071 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GLI3P10071 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI3P10071 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI3P10071 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GLI3P10071 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI3P10071 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GLI3P10071 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI3P10071 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GLI3P10071 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI3P10071 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI3P10071 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI3P10071 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GLI3P10071 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI3P10071 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI3P10071 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GLI3P10071 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI3P10071 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI3P10071 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI3P10071 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI3P10071 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GLI3P10071 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GLI3P10071 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GLI3P10071 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GLI3P10071 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GLI3P10071 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GLI3P10071 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GLI3P10071 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GLI3P10071 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GLI3P10071 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GLI3P10071 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GLI3P10071 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms