Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC192P0DO97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC192P0DO97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC192P0DO97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC192P0DO97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms