Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C8orf88P0DMB2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf88P0DMB2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1726 ms