Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00032P0C843 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00032P0C843 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00032P0C843 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00032P0C843 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00032P0C843 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms