Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBK2P0C263 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBK2P0C263 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK2P0C263 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBK2P0C263 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms