Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF3P09919 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF3P09919 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3P09919 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3P09919 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3P09919 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF3P09919 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3P09919 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3P09919 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3P09919 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF3P09919 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF3P09919 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3P09919 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3P09919 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF3P09919 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3P09919 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3P09919 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3P09919 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3P09919 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF3P09919 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3P09919 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3P09919 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3P09919 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3P09919 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSF3P09919 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3P09919 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3P09919 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF3P09919 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF3P09919 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3P09919 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3P09919 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3P09919 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF3P09919 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3P09919 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3P09919 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF3P09919 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF3P09919 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF3P09919 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3P09919 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3P09919 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3P09919 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3P09919 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3P09919 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3P09919 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3P09919 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3P09919 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3P09919 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3P09919 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3P09919 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3P09919 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSF3P09919 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3P09919 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3P09919 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3P09919 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3P09919 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3P09919 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3P09919 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3P09919 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3P09919 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3P09919 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms